Родился в семье режиссёра и фотомодели. Отец, Александр Михайловский и мать, Алевтина (Алиса) Ивановна, развелись, когда Никита был маленький. У него появился отчим, которого он долгое время считал своим родным отцом. Отчим — режиссёр Виктор Сергеев, впоследствии занимавший пост директора «Ленфильма». Мать умерла от порока сердца, когда Никите Михайловскому было 16 лет.
С детских лет работал манекенщиком, а отчим помог Михайловскому пробиться в кино. Впервые в эпизоде кино он снялся в картине «Ночь на 14-й параллели», которая вышла на экраны в 1972 году. Стал известным после выхода в 1981 году фильма «Вам и не снилось…». Поступил в ЛГИТМИК на курс Р. Агамирзяна, который окончил в 1986 году. Также занимался живописью, писал и иллюстрировал детские книжки.
В конце 80-х Никита Михайловский принимал участие в трэш-фильмах Бориса Юхананова, которые они вместе сняли в рамках работы так называемой «неформатной студии» «Театр-Театр», которая была частью подпольной ленинградской культуры конца 1980-х: в частности, таких видео как «Сумасшедший принц» и других. Перформансы в данных видеоработах часто предполагали обнажение со стороны актеров, также содержатся сцены мочеиспускания и обильная обсценная лексика
В 1985—1990 годах сыграл ещё несколько экранных ролей, однако известными и популярными стали лишь некоторые работы актёра — «Ради нескольких строчек», «Акселератка», «Мисс миллионерша», «Зонтик для новобрачных». Снимался вместе с Алексеем Баталовым, Верой Глаголевой, Нийоле Ожелите, Николаем Караченцовым и другими. Всего в его фильмографии 19 фильмов.
В 1990 году Никита Михайловский вместе с женой организовал в Англии выставку собственных художественных работ, средства от продаж которых пошли на лечение онкобольных детей. Там же у него был диагностирован лейкоз, ему требовалась пересадка костного мозга. Некоторую часть средств на лечение направили Борис Ельцин, Гарри Каспаров и даже Маргарет Тэтчер, однако проведённая операция успеха не принесла.
Умер в Лондоне по одним данным 21 апреля, по другим — 24 апреля, 1991 года на 28-м году жизни от лейкоза. Похоронен на Комаровском кладбище под Санкт-Петербургом.